Le laboratoire Plantes et pathogènes est équipé pour la culture et la caractérisation génétique et phénotypique de bactéries et de champignons, pour le diagnostic conventionnel et moléculaire de maladies des plantes, pour le profilage génétique de plantes ou de microbes, le sexage moléculaire de plantes de certaines espèces, la génomique de bactéries et champignons, la métagénomique et la métatranscriptomique, les cultures spéciales d’espèces horticoles et la culture in vitro végétale.