Les sujets de recherche et les prestations de service développés au sein du groupe EISA s’articulent autour de la gestion durable des écosystèmes aquatiques lotiques et lentiques.
Ils ciblent notamment les diagnostics écologiques, la restauration et le suivi écologique d'habitats et d'espèces. L’accent est principalement mis sur les problématiques découlant des perturbations locales ou globales liées aux activités humaines.
Les projets de recherche sont développés en étroit partenariat avec d'autres institutions (Universités, Hautes écoles, Établissements publics de recherche, Musées, Jardins Botaniques) et les professionnels (administrations, associations, bureaux d'études, gestionnaires, entreprises actives dans le domaine et autres praticiens). La participation à divers projets en Europe et sur d’autres continents, contribue au développement des relations internationales.
