La Haute école de musique Genève – Neuchâtel (HEM) collabore avec de nombreuses institutions internationales en matière d'enseignement et de culture. Ses partenaires se situent en Europe, en Amérique et en Asie. Elle accueille de nombreux étudiants venant de l’étranger. Elle offre également des programmes d’échanges pour les étudiants ou les professeurs avec d’autres institutions musicales.

Des projets pédagogiques et artistiques sont par ailleurs développés aves des institutions partenaires, afin de favoriser les échanges avec les cultures traditionnelles non européennes.

Quelques institutions internationales avec lesquelles la HEM collabore de façon régulière: Conservatoire National de Musique Edward Saïd à Jérusalem, the Fundación del Estado para el Sistema de las Orquestras Juveniles e Infantiles de Venezuela, the Núcleos Estaduais de Orquestras Juvenis e Infantis da Bahia (NEOJIBA) au Brésil, Kunitachi College of Music Japan, Shanghai Conservatory of Music.